در ابتدای این همایش سیدهادی موسوی دبیر اجرایی سومین همایش طبیب روحانی اظهار داشت: دانشگاه علوم پزشکی تهران به عنوان نماد آموزش عالی کشور در کنار پیشرفتهای علمی، آموزشی و تحقیقاتی مسئولیت سنگینی را در حوزه نشر فرهنگ دینی و اخلاق برعهده دارد و گام‌های اساسی در این راستا برداشته است.وی برگزاری همایش طبیب روحانی را یکی از سرفصل‌های نشر فرهنگ دینی برشمرد و افزود: شخصیت آیت‌الله علامه حسن‌زاده آملی در علوم مختلف مانند تفسیر، فقه، علم کلام، طب قدیم، نجوم، ادبیات، منطق، فلسفه، عرفان و اخلاق سرآمد است و گویی ایشان در جست‌وجوی همه دانش‌ها بوده‌اند. وی ابراز داشت: علامه با کتاب و کاغذ همنشین بوده است و لحظه‌ای را دور از تحقیق و تحصیل نگذرانده‌اند.
در ادامه این همایش دکترمحمدرضا منصوری، سرپرست دانشگاه علوم پزشکی تهران طی سخنانی خاطرنشان کرد: برگزاری این گونه همایش‌ها به خاطر هماهنگی و تلفیقی است که باید بین طبیب روحانی و جسمانی وجود داشته باشد و ما طبیبان جسمانی نیاز مبرم‌تری برای درمان دردهای روانی و کمبودهای روحی به طبیبان روحانی داریم.وی با تأکید بر اینکه تزکیه و تعلیم همان طور که در قرآن هم اشاره شده باید در کنار هم باشد افزود: بنابر خواسته و تلاش امام راحل و مقام معظم رهبری باید برای وحدت حوزه و دانشگاه تلاش کنیم که برگزاری این گونه بزرگداشت‌ها می‌تواند مفید واقع شود.
درادامه این مراسم آیت الله محمد صادق آملی لاریجانی، ریاست محترم قوه قضاییه در سخنانی به تجلیل از مقام علمی و معنوی حضرت علامه پرداخت.رییس قوه قضاییه گفت: مراسم بزرگداشت آیت‌الله حسن‌زاده آملی برای تجلیل از مقام معرفتی این عالم ربانی است که نظر به وجه او عبادت است.آیت‌الله محمد صادق آملی لاریجانی در سومین همایش طبیب روحانی که برای بزرگداشت علامه آیت‌الله حسن‌زاده آملی برگزار شد، با تبریک حلول ماه رجب ابراز امیدواری کرد که در این ماه عظیم‌شان از بندها و گناهان آزاد شویم.
 رییس قوه قضاییه افزود: حضرت علامه آیت‌الله حسن‌زاده آملی از مفاخر روزگار و چهره‌های برجسته جهان امروز است و حوزه‌های علمیه سال‌هاست از محضر ایشان فیض می‌برند، بنده کمتر از آن هستم که در توصیف مقام شامخ ایشان سخن بگویم؛ این همایش نیز کمتر از آن است که بتواند از مقام ایشان تجلیل کند. اما با برگزاری چنین مراسم‌های راه‌ها برای نشان دادن علما و بزرگان ترسیم می‌شود.
در بخش دیگری از این همایش حضرت استاد آیت ا... رمضانی از شاگردان استاد فرزانه حسن زاده آملی طی سخنانی اظهار داشت بزرگداشت شخصیتهای ما در حقیقت به دو منظور صورت می گیرد یک منظور اخبار از متن واقع به این معنی که بزرگداشت یعنی اخبار از بزرگی و عظمت یک شخصیت یک تشریفات نیست این بزرگداشت یک تعارف نیست بزرگداشت شخصیتها بلکه حرکت در راستای تطابق بین مقام (ثبوت) و اثبات است مقام ثبوت یعنی متن واقع مقام اثبات یعنی نگرشها ونظریات و عالم علم و معرفت یعنی ما با بزرگداشت شخصیتها داریم اخبار می کنیم از متن واقع و خبر می دهیم که این انسان در متن واقع و در مقام ثبوت بزرگ است جدا چون انسانها یک ملکی دارند و یک ملکوتی ملک همین جنبه ظاهری آنهاست جثه بدنی آنها است حالا یا کوچک هستند یا بزرگ هستند یا متوسط هستند یا زشت هستند یا یا زیبا هستند و این جنبه ملکی آنها است اما جنبه ملکوتی آنها جنبه ماورایی آنها است جنبه ماورایی مثل جنبه ملکی بزرگی دارد کوچکی دارد زیبایی و زشتی دارد وقتی ما داریم بزرگداشت برگزار می کنیم برای شخصیتهای بزرگ در حقیقت داریم از آن عالم ماورا خبر می دهیم و می گوییم این شخص بزرگ است که ما آن را بزرگ می داریم در حقیقت عظیم است که ما داریم آن را تعظیم می کنیم بر اساس تعارف و تشریفات و آداب و رسوم ظاهری نیست بنابر فرمایش حضرت امام صادق (ع) که فرمود من تعلم و عَمِل و علِّم لله دعی فی ملکوت والسموات عظیما هر کس که علم را فرا بگیرد و آن را بکار ببندد و به دیگران تعلیم بدهد در ملکوت آسمانها آن را بزرگ می کند این فرمایش حکایت از این می کند که شخصی که در مسیر تعلیم و تعلم و عمل صالح و اخلاص قدم نهاده است این بزرگ می شود در دید ملکوتیان و در عالم ملکوت این در حقیقت بزرگی و عظمت واقعی یک شخصیت است مولوی هم بسیار زیبا در مثنوی می گوید جانور فربه شود از راه نوش   /  آدمی فربه شود از راه گوش  / جانور فربه شود لیک از علف / آدمی فربه زه عز است و شرف در این دو بیت را مولوی عظمت جنبه حیوانی انسان را ربط داده به خوردن و آشامیدن و عظمت و بزرگی ملکوتی و جنبه انسانی انسان را ربط داده به علم و عمل در آنجا که می فرماید از راه گوش ناظر به جنبه علمی است یعنی انسان می شنود معارف را و از استاد فرا می گیرد و در درون خودش و در جان خودش آنها را هضم این درست مثل اینست که آب به پای یک درختی بریزی و آن را زنده کنی یا یک حیوانی از آب بنوشد و طراوت و حیات و زندگی پیدا بکند و این جنبه علمی است که به منزله آب است و آنجایی هم که می فرماید عز و شرف جنبه عمل را دارد می فرماید جناب مولوی چون عمل دارای دو تا حیثیت است یکی حیثیت ایجابی یکی حیثیت سلبی انسان برخی از کارها را انجام بدهد و برخی از کارها را نباید انجام بدهد جنبه سلبی آن همان عز است عز یعنی عدم انفعال تأثیر ناپذیری از امور منفی شرف یعنی کارهایی که انسان باید ایجابی انجام بدهد کارها و عمل صالح بالاخره انسان با پرهیز از کارهای منفی و با انجام کارهای مثبت که از آن تعبیر کرده به عز و شرف انسان چاق می شود فربه می شود به منزله خوردن است خوردنیها است جنبه حیوانی انسان خوراک است و نوشیدنیها و جنبه ملکوتی انسان عمل است و علم و معرفت لذا جناب مولوی در این زمینه اینطور فرمایش می فرمایند و حاکی از عظمت انسانها است معلوم می شود وقتی داریم تجلیل می کنیم از یک شخصیتی و بزرگداشت او را برگزار می کنیم داریم می گوییم این انسان فربه است این انسان بزرگ است در متن واقع در دید خداوند تبارک و تعالی و ملکوتیان از عظمت ملکوتی برخوردار است عالم است و عامل فهیم است و جامع این یک پیام و یک هدف که اخبار است اما هدف دوم این است که دیگران را انسان تشویق کند و همانگونه که خدمت شما عرض کردم فطرتا انسان مایل به علم است مایل به بزرگان عالم علم و معرفت است مایل به انسانهای پاک و باتقوا است وقتی ما مجلس بزرگداشت برگزار می نماییم و شخصیتهای ما را معرفی می کنیم  به نسل نو و جوان و پاک و دلهای پاک و آماده مطمئنا این درسی است به آنها و تشویقی است نسبت به آنها در همان مسیری گام بردارند که این قله های علم و معرفت گام برداشتند
وی در پایان غزلی را تقدیم استاد بزرگوار حضرت آیت ا... حسن زاده آملی نمود::
بيا كه موسم ياس و سمن شد        زمان سبزه و دشت و دمن شد
نواي دل نواز بلبل آمد                     صداي شيون زاغ و زغن شد
غم و اندوه از اينجا رخت بر بست       از اين خانه همه رنج و محن شد
ملايك بر سرير دل نشستند             عجب خاكي به فرق اهرمن شد
بيفشانيد دست و پا بكوبيد              كه گاه گفتن سرّ و علن شد
رسيدم خدمت استاد اعظم             همه انواع همّ و غمّ زمن شد
چو افشانيد در قلبم معارف              درون من حسن اندر حسن شد
زمين صحبت و تعليم و درسش         ديار غربتم عين و وطن شد
نموده عبد خود من را به تعليم          از اين رو نام من عبد الحسن شد
در ادامه این همایش دکتر محمد باقر لاریجانی و حجت الاسلام والمسلمین محمدیان به ایراد سخنرانی پرداختند و در پایان جناب آقای دکتر اصفهانی در مورد طب اسلامی سخنرانی کردند.
لازم به ذکر است که این مراسم همراه با پخش کلیپهایی از زندگی حضرت استاد علامه حسن زاده آملی و شعرخوانی  دکتر موسوی گرمارودی و علیرضا قزوه همراه بود.